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Biotech Blog
2025-03-31
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Equipment Manual
Cutin monomer analysis
Jianfeng Jin
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2025-03-30
以上工具使用前用氯仿清洗。 […] 2 ml Methanolic HCl配制:0.3 ml 8%盐酸甲醇溶液(9.7 ml 浓盐酸 + 41.5 ml 甲醇)+ 0.2 ml 甲苯 + 1.5 ml 甲醇。 […] 20 ml Methanolic HCl配制: 17.47 ml甲醇 + 582 µl浓盐酸 + 2 ml甲苯。 […] 母液5 mg/ml:5 mg粉末 + 1 ml甲醇。 […] 如果样品比较多,那么step2中可以增加methanol/HCl的用量。若相分离过程中,界限不明确,需要增加更多的有机溶剂或者水剧烈振荡。…
OwnTime
首次环西湖10公里跑
Package Build
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2025-03-30
早上纠结许久,包括现在过去是否人会太多,是否不够早,还是下次早一点以及既然没参加上虞半程马拉松(报名的5km,因实验最后没有参加,略显可惜)那就去跑一个西湖弥补遗憾。昨晚睡眠充足,还是狠心出门坐地铁到凤起路,走至少年宫,到达北山街。 […] 天阴,山雨朦胧,江南水乡美景。水中鸳鸯戏水,添加了一份动感。就在这个位置开始起跑。 西湖似乎有种魔力,经常会停下来,拿出手机拍照,变成我是来旅游而不是跑步。拍了很多照片,不知道途中停了多少次。太多老年旅游团早早的占领了西湖,终于明白教练为啥要6:30就开始跑。 […] 弓步拉腿时,开头望见了枝条,突然有点触动。与此同时,上虞马拉…
Gene
Tomato cuticle-related TFs
Package Build
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2024-10-12
Function: Cuticular wax biosynthesis Original Article: Xiong C, Xie Q, Yang Q, Sun P, Gao S, Li H, Zhang J, Wang T, Ye Z, and Yang C. WOOLLY, interacting with MYB transcription factor MYB31, regulates cuticular wax biosynthesis by modulating CER6 expression in tomato. Plant J. 2020:103(1):323–337.…
Method
Finding the transgene insertion site
Package Build
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2024-09-22
需解决的问题:转基因株系出现某种表型,发现可能是因为转基因片段插入,导致某个基因功能缺失。那么具体插在哪条染色体和那个基因,通过全基因组重测序,分析插入位点。 […] # macOS安装miniconda brew install --cask miniconda 2. 创建新的Conda环境 创建一个名为 tomato_reseq 的新环境,并激活它: # 添加bioconda和conda-forge频道 conda config --add channels defaults conda config --add channels bioconda conda config…
Method
How to find the corresponding tomato IL and BIL lines according to SL gene
Package Build
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2024-09-12
ILs主要是通过LA0716和M82杂交,然后重复回交,最终染色中含有LA0716单一染色体片段。目前,使用的ILs有76个,覆盖了整个番茄基因组,图中A图的黑色线段就是LA0716的染色体片段。这些ILs,为QTL鉴定作出了重要的贡献。 BIL是通过LA0716和M82杂交,然后与M82回交2-3代,最后自己8代,最终得到染色体中有多个LA0716片段,且片段更小,图中为BILs构建的过程。目前,BILs的数量为466个line,相比ILs,能够更精细的确定性状相关区域。 […] […] 换种说法,就是SP基因在M82中表达,有点类似在M82中做了转基因,使其表…
Equipment Manual
Freeze Dryer User's Guide
lxmic
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2024-09-11
按一下屏幕右手边按钮开关,指示灯亮即开机,屏幕开始亮,在屏幕空白处点击进入界面。 […] 点击压缩机,显示红色表明开启(pic1),有很大的噪音。 […] 拧阀门至无法拧动(pic2)。 […] 等温度降至-60至-70°C (pic3),然后放样品,把强化玻璃罩放好。 […] 点击打开真空泵(pic4),开始抽真空。等待真空度达到500以下(pic5),说明设备气密性没有问题,可以离开让仪器工作。
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